強颱莫拉克一走，嘉義市環保局人員就全體總動員，在清除湖內里等7處淹水區垃圾、污泥並做清洗後，同時自13日，展開全市全面消毒工作，避免孳生蚊蟲、傳播病毒，務必讓市民有個乾淨衛生的環境。

莫拉克颱風來襲期間，環保局全面動員，隨時冒著強大風雨，外出清理掉落廣告招牌等，以防砸傷市民，颱風過後，環保局人員也沒因此輕鬆，反而投入更多人力，分批前往後湖里、湖內里、紅瓦厝社區、荖藤宅、光正街、溪興街、鹿寮里等淹水地區，展開淤泥清除工作，也清運走大批垃圾，環保局人員不畏全身已髒透，在清理完後，還以清水將積水區清洗乾淨。

在市長黃敏惠要求下，以最快速度，讓全市恢復原有潔淨面貌，環保局環保志工隊也加入協助清理環境，以補環保局人力不足。在市容大致恢復原貌後，環保局仍不敢休息，為防大雨過後易生蚊蟲、傳播病毒而影響市民健康，自13日起，展開全市全面性消毒工作，為讓消毒工作達到更大效果，環保局呼籲民眾配合，先做好居家環境清潔工作，清除積水容器、廢棄容器，像輪胎、鐵鋁罐、帆布、寶特瓶、盆栽墊盤等，避免病媒蚊孳生，也請市民若有大型廢棄物，撥電話：05-2251775，環保局會儘速派員清運